Отделение оказывает хирургическую помощь по следующим направлениям:

• Буллезная эмфизема легких и ее осложнения
• Нагноительные заболевания легких
• Осложненная травма груди, посттравматические деформации грудной стенки
• Хронические торакальные свищи, остеомиелит грудины
• Релаксация диафрагмы, диафрагмальные грыжи
• Лимфоаденопатии средостения, диссеминированные процессы в легких
• Плевриты неясной этиологии
• Рецидивирующие плевриты установленной этиологии
• Кисты, опухоли средостения, тимомы
• Доброкачественные кисты и опухоли, в т.ч. паразитарные, легких, грудной стенки, диафрагмы
• Пороки развития легких
• Внутрипросветные опухоли бронхов и трахеи.

В отделении выполняются все виды современных операций на легких, как в традиционном так и в эндоскопическом вариантах.

Нижегородская (Горьковская) школа торакальной хирургии основана академиком Б.А.Королевым в стенах Пятой больницы, в 1951г. он выполнил первую анатомическую резекцию легкого.
В 1969 году было создано отделение хирургии легких, первым заведующим была Р.И.Чернова, научным руководителем – профессор А.П.Широкова. В дальнейшем руководителями отделения были Е.И.Решетов, А.А.Смородин, научным руководителем – профессор В.Ю.Горшков. С 2009 года на базе отделения открыт Нижегородский центр торакальной хирургии.